Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP4R4Q6NUP7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms