Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms