Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms