Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms