Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms