Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms