Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms