Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIK1Q3SY52 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIK1Q3SY52 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms