Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX4Q33E94 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms