Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms