Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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