Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HADHQ16836 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HADHQ16836 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HADHQ16836 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HADHQ16836 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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