Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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