Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms