Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP7Q16576 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms