Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDB1Q16531 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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