Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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E2F4Q16254 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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E2F4Q16254 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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E2F4Q16254 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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