Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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