Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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EFNB3Q15768 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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