Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP4Q15650 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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