Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TLR1Q15399 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TLR1Q15399 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms