Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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