Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms