Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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CHD4Q14839 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CHD4Q14839 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CHD4Q14839 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CHD4Q14839 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CHD4Q14839 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHD4Q14839 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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