Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms