Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTTNQ14247 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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