Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms