Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms