Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms