Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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