Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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