Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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