Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP1Q13363 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms