Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.383e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 NRBP1-206ENST00000460499 2561 ntTSL 216.4■□□□□ 0.223e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.961e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.791e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.441e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 517.83■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 CD59-212ENST00000533181 424 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.186e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 CMBL-202ENST00000503834 442 ntTSL 35.61□□□□□ -1.516e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.733e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.233e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.24e-10■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 B2M-206ENST00000559720 1220 ntTSL 511.38□□□□□ -0.592e-18■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 NMRAL1-204ENST00000571448 805 ntTSL 215.94■□□□□ 0.145e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 EXOSC10-207ENST00000474216 2007 ntTSL 216.04■□□□□ 0.164e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 EXOSC10-210ENST00000490565 421 ntTSL 213.36□□□□□ -0.274e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 EXOSC10-202ENST00000376936 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.584e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 EXOSC10-201ENST00000304457 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-7■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SERINC3-202ENST00000342374 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 SERINC3-203ENST00000411544 812 ntTSL 311.03□□□□□ -0.641e-8■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 CD59-211ENST00000528987 3716 ntTSL 1 (best)6.52□□□□□ -1.372e-6■■□□□ 14.3
PABPC4Q13310 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.791e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PSME2-205ENST00000559005 496 ntTSL 29.94□□□□□ -0.823e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.663e-15■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.394e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.774e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.664e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.454e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.414e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.761e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.288e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.998e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 USP20-204ENST00000472108 1811 ntTSL 218.35■□□□□ 0.534e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 USP20-203ENST00000372429 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-35■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-211ENST00000430901 483 ntTSL 417.63■□□□□ 0.412e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SRRT-210ENST00000477529 540 ntTSL 216.8■□□□□ 0.284e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SRRT-203ENST00000445337 446 ntTSL 37.14□□□□□ -1.274e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TSC22D4-206ENST00000496728 837 ntTSL 323.96■■□□□ 1.436e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.176e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TSC22D4-203ENST00000423266 1071 ntTSL 219.64■□□□□ 0.736e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.546e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.347e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 27e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.927e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.877e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.787e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-211ENST00000433483 769 ntTSL 526.03■■□□□ 1.767e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-203ENST00000373496 693 ntTSL 325.98■■□□□ 1.757e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.687e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DBNL-218ENST00000485932 553 ntTSL 425.13■■□□□ 1.617e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-210ENST00000427078 816 ntTSL 525.12■■□□□ 1.617e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.567e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.544e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ACOT8-211ENST00000488679 1013 ntTSL 524.68■■□□□ 1.544e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DBNL-209ENST00000441904 878 ntTSL 324.24■■□□□ 1.477e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.437e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-203ENST00000458117 782 ntTSL 223.81■■□□□ 1.47e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ACOT8-204ENST00000461272 1197 ntTSL 523.66■■□□□ 1.384e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 COMMD1-208ENST00000472729 629 ntTSL 323.49■■□□□ 1.357e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 323.2■■□□□ 1.38e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-202ENST00000440963 575 ntTSL 223.09■■□□□ 1.297e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.287e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 COMMD1-207ENST00000471704 604 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.257e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.247e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.227e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 COMMD1-204ENST00000445644 549 ntTSL 422.67■■□□□ 1.227e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.197e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DBNL-205ENST00000439815 561 ntTSL 422.45■■□□□ 1.187e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.177e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.177e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.177e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RAB4B-EGLN2-203ENST00000601949 482 ntTSL 422.34■■□□□ 1.177e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DBNL-216ENST00000464762 693 ntTSL 521.98■■□□□ 1.117e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.094e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.097e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.087e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.017e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.994e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.974e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.937e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.887e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.877e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DBNL-222ENST00000498733 1401 ntTSL 220.36■□□□□ 0.857e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.847e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)20.16■□□□□ 0.827e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.827e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.777e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RAB4B-205ENST00000598430 1728 ntTSL 219.73■□□□□ 0.757e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.727e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.727e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.697e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.687e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 219.28■□□□□ 0.687e-6■■□□□ 14.2
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 196.4 ms