Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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