Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NME3Q13232 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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NME3Q13232 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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NME3Q13232 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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NME3Q13232 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NME3Q13232 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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