Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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