Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM2Q13029 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms