Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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