Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD3Q12873 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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