Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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STX4Q12846 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STX4Q12846 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STX4Q12846 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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