Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TROQ12816 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TROQ12816 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TROQ12816 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TROQ12816 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TROQ12816 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TROQ12816 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TROQ12816 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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