Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SREBF2Q12772 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms