Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms