Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LRP1Q07954 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms