Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOS1Q07889 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms