Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms