Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms