Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG1Q06432 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms