Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms